在写压力负载比较重的MySQL实例上,InnoDB可能积累了较长的没有被purge掉的transaction history,导致实例性能的衰减,或者空闲空间被耗尽,下面就来看看它是怎么产生的,或者有没有什么方法来减轻,避免这样的问题出现。
InnoDB是一个事务引擎,实现了MVCC特性,也就是在存储引擎里对行数据保存了多个版本。在对行数据进行delete或者update更改时,行数据的前映像会保留一段时间,直到可以被删除的时候。
在大部分OLTP负载情况下,前映像会在数据操作完成后的数秒钟内被删除掉,但在一些情况下,假设存在一些持续很长时间的事务需要看到数据的前映像,那么老版本的数据就会被保留相当长一段时间。
虽然MySQL 5.6版本增加了多个purge threads来加快完成老版本数据的清理工作,但在write-intensive workload情况下,不一定完全凑效。
Peter Zaitsev 使用sysbench的update进行的测试,无论是 innodb_purge_threads=1 还是8的时候,显示的transaction history快速增长的情况,如下图所示:
transaction history增长情况
下面看一下同步测试过程中purge的速度(可以通过 I_S.innodb_metrics
进行查询):
InnoDB purge 情况
显示在并发 process 的过程中,purge thread 其实处在饥饿状态,待sysbench结束,purge线程满载运行清理工作。
对于这个测试结果,这里需要说明下:
我们来看下出现transaction history增长最常见的两种场景:
大查询
如果你在一张大表上发起一个长时间运行的查询,比如mysqldump,那么purge线程必须停下来等待查询结束,这个时候transaction undo就会累积。如果buffer pool中 free page紧张,undo page 还会被置换到disk上,加剧purge的代价。
MySQL重启
即使transaction history并没有急剧增加,但MySQL重启操作,buffer pool的重新预热,还是导致purge变成IO密集型操作。不过MySQL 5.6提供了InnoDB buffer pool的dump和reload方法,可以显著减轻purge的IO压力。
这里介绍一下如何查看buffer pool中undo page的cache情况,percona的版本上提供了 I_S.innodb_rseg
记录undo的分配和使用情况:
mysql> select sum(curr_size)*16/1024 undo_space_MB from innodb_rseg; +---------------+ | undo_space_MB | +---------------+ | 1688.4531 | +---------------+ 1 row in set (0.00 sec) mysql> select count(*) cnt, count(*)*16/1024 size_MB, page_type from innodb_buffer_page group by page_type; +--------+-----------+-------------------+ | cnt | size_MB | page_type | +--------+-----------+-------------------+ | 55 | 0.8594 | EXTENT_DESCRIPTOR | | 2 | 0.0313 | FILE_SPACE_HEADER | | 108 | 1.6875 | IBUF_BITMAP | | 17186 | 268.5313 | IBUF_INDEX | | 352671 | 5510.4844 | INDEX | | 69 | 1.0781 | INODE | | 128 | 2.0000 | SYSTEM | | 1 | 0.0156 | TRX_SYSTEM | | 6029 | 94.2031 | UNDO_LOG | | 16959 | 264.9844 | UNKNOWN | +--------+-----------+-------------------+ 10 rows in set (1.65 sec)
从这两个information_schema下的两张表可以看到:undo space使用的总大小是1.7G,而buffer pool中cached不足100M。
在一定的写压力情况下,并发进行一些大查询,transaction history就会因为undo log无法purge而一直增加。
InnoDB提供了两个参数 innodb_max_purge_lag
, innodb_max_purge_lag_delay
来调整,即当 trx_sys->rseg_history_len
超过了设置的 innodb_max_purge_lag
,就影响DML操作最大delay不超过 innodb_max_purge_lag_delay
设置的时间,以microseconds来计算。
其核心计算代码如下:
/*******************************************************************//** Calculate the DML delay required. @return delay in microseconds or ULINT_MAX */ static ulint trx_purge_dml_delay(void) /*=====================*/ { /* Determine how much data manipulation language (DML) statements need to be delayed in order to reduce the lagging of the purge thread. */ ulint delay = 0; /* in microseconds; default: no delay */ /* If purge lag is set (ie. > 0) then calculate the new DML delay. Note: we do a dirty read of the trx_sys_t data structure here, without holding trx_sys->mutex. */ if (srv_max_purge_lag > 0) { float ratio; ratio = float(trx_sys->rseg_history_len) / srv_max_purge_lag; if (ratio > 1.0) { /* If the history list length exceeds the srv_max_purge_lag, the data manipulation statements are delayed by at least 5000 microseconds. */ delay = (ulint) ((ratio - .5) * 10000); } if (delay > srv_max_purge_lag_delay) { delay = srv_max_purge_lag_delay; } MONITOR_SET(MONITOR_DML_PURGE_DELAY, delay); } return(delay); }
但这两个参数设计有明显的两个缺陷:
缺陷1:针对total history length
假设transaction history中保留两类records,一类是是马上可以被purge的,一类是因为active transaction而不能purge的。但大多数时间,我们期望的是purgable history比较小,而不是整个history。
缺陷2:针对大小而非变化
trx_sys->rseg_history_len
是一个当前history的长度,而不是一个interval时间段内undo的增长和减少的变化情况,导致 trx_sys->rseg_history_len
一旦超过 innodb_max_purge_lag
这个设定的值,就对DML产生不超过 innodb_max_purge_lag_delay
的时间delay,一旦低于这个值马上delay 时间就又恢复成 0。
在对系统的吞吐监控的时候,会发现系统抖动非常厉害,而不是一个平滑的曲线。类似于下图:
Purge 造成系统抖动
针对InnoDB的purge功能,可以从以下几个因素来综合考虑:
以上6条可以针对purge线程进行一些改良。
在当前的 MySQL 5.6 版本上,我们能做哪些调整或者调优方法,以减少transaction history增加带来的问题呢?
监控
监控 trx_sys
的 innodb_history_list_length
,为它设置报警值,及时关注和处理。
调整参数
如果你的实例是写压力比较大的话,调整 innodb_purge_threads=8
,增加并发purge线程数。
谨慎调整 innodb_max_purge_lag
和 innodb_max_purge_lag_delay
参数,依据现在的设计,可能你的实例的吞吐量会急剧的下降。
purge完之后再shutdown
大部分的case下,MySQL实例重启后,会发现purge的性能更差,因为undo page未命中的原因,并且是random IO请求。
如果是正常shutdown,就等purge完成再shutdown;如果是crash,就启动后等purge完成再接受业务请求。
预热
使用MySQL 5.6 提供的 innodb_buffer_pool_dump_at_shutdown=on
和 innodb_buffer_pool_load_at_startup=on
进行预热,把undo space page预热到buffer pool中。