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基于heatmaply和plotly的交互式热力图

手把手做个新鲜出炉的网页交互热图

Interactive Heatmap

利用R绘制热力图比较简单，而随着可视化工具喷涌，交互式热力图在R中的实现也常见起来。以前有heatmap包，d3heatmap包，今天则出现了干脆利落的heatmaply包（我喜欢）。

新包作者Jonathan Carroll基于gglot2和plotly.js开发了这一款新包，并且可以完美的运行在各个端口。如下图，用老家伙mtcars生成了内嵌在网页中的交互热力图。

而当我们运行下方的代码时，在Rstudio中会出现同样的效果：

install.packages("heatmaply")

library(heatmaply)

heatmaply(mtcars, k_col = 2, k_row = 3) %>% layout(margin = list(l = 130, b = 40))

heatmap-r

基于heatmaply和plotly的交互式热力图

Do It Yourself

1. 安装相关的包：作者提供了以下两种安装方式

#1-稳定版本的

install.packages("heatmaply")

#2-github开发版

#先安装或者运行

install.packages('installr'); install.Rtools()

#安装devtools

install.packages.2 <- function (pkg) if (!require(pkg)) install.packages(pkg)#制定函数

install.packages.2('devtools')

devtools::install_github("ropensci/plotly")

devtools::install_github('talgalili/heatmaply')

随后开始运行

library(heatmaply)

heatmaply(mtcars)

heatmaply(mtcars, k_col = 2, k_row = 3) %>% layout(margin = list(l = 100, b = 100))

#k_col、k_row设定色彩种类,数值不应该超过所涉变量的范围

#Pipe操作连接margin函数以调整显示尺寸

heatmaply(cor(mtcars), k_col = 2, k_row = 2,limits = c(-1,1)) %>% layout(margin = list(l =

40, b = 40),colors = heat.colors(100))

#插入相关系数函数作为热力数值，limits作为显示范围从负相关到正相关.colors函数用以调整色彩，其他命令如下

heatmaply(cor(mtcars),

scale_fill_gradient_fun = ggplot2::scale_fill_gradient2(low = "blue",

high = "red", midpoint = 5, limits = c(-1, 1)),k_col = 2, k_row = 3) %>% layout(margin =

list(l = 100, b = 100))

基本上，这些代码已经可以在R实现交互式热力图了。下面的问题是如何在网页端中实现？

Plotly For R

终于轮到Plotly出场了。

首先需要注册一个Plotly网站的帐号，注册成功后，进入到个人页面（profile）中，点击API Keys产生自己的钥匙。

基于heatmaply和plotly的交互式热力图

之后，就可以回到R部署所需的包：

install.packages("plotly")

library(plotly)

plotly_username="******"#你的用户名

plotly_api_key="*****"#你的API

library(heatmaply)#加载heatmaply包

a<-heatmaply(mtcars, k_col = 2, k_row = 3) %>% layout(margin = list(l = 130, b = 40))

plotly_POST(a, filename = "heatmap", fileopt = "new",sharing = "public")

到此，plotly就已经成功上传了你的作品。然后回到自己的页面，就会看到已经出现的分享页面

基于heatmaply和plotly的交互式热力图

选择iframe格式，就可以轻松把他们插入到自己的页面了。如下是我生成的页面：

Over

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原文 http://www.dataguru.cn/article-9464-1.html

正文到此结束

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