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面试被问傻!5亿个数大文件怎么排序?

曾经被问傻的一道面试题分享给你:

给你1个文件 bigdata ,大小4663M,5亿个数,文件中的数据随机,如下一行一个整数:

6196302  
3557681  
6121580  
2039345  
2095006  
1746773  
7934312  
2016371  
7123302  
8790171  
2966901  
...  
7005375

现在要对这个文件进行排序,怎么搞?

内部排序

先尝试内排,选2种排序方式:

3路快排:

private final int cutoff = 8;  
  
public <T> void perform(Comparable<T>[] a) {  
  perform(a,0,a.length - 1);  
}  
  
private <T> int median3(Comparable<T>[] a,int x,int y,int z) {  
  if(lessThan(a[x],a[y])) {  
    if(lessThan(a[y],a[z])) {  
      return y;  
    }  
    else if(lessThan(a[x],a[z])) {  
      return z;  
    }else {  
      return x;  
    }  
  }else {  
    if(lessThan(a[z],a[y])){  
      return y;  
    }else if(lessThan(a[z],a[x])) {  
      return z;  
    }else {  
      return x;  
    }  
  }  
}  
  
private <T> void perform(Comparable<T>[] a,int low,int high) {  
  int n = high - low + 1;  
  
  if(n <= cutoff) {  
    InsertionSort insertionSort = SortFactory.createInsertionSort();  
    insertionSort.perform(a,low,high);  
  
  }else if(n <= 100) {  
    int m = median3(a,low,low + (n >>> 1),high);  
    exchange(a,m,low);  
  
  }else {  
    int gap = n >>> 3;  
    int m = low + (n >>> 1);  
    int m1 = median3(a,low,low + gap,low + (gap << 1));  
    int m2 = median3(a,m - gap,m,m + gap);  
    int m3 = median3(a,high - (gap << 1),high - gap,high);  
    int ninther = median3(a,m1,m2,m3);  
    exchange(a,ninther,low);  
  }  
  
  if(high <= low)  
    return;  
  
  int lt = low;  
  
  int gt = high;  
  
  Comparable<T> pivot = a[low];  
  int i = low + 1;  
  
  
  
  while (i <= gt) {  
    if(lessThan(a[i],pivot)) {  
  
      exchange(a,lt++,i++);  
    }else if(lessThan(pivot,a[i])) {  
      exchange(a,i,gt--);  
    }else{  
      i++;  
    }  
  }  
  
  
  perform(a,low,lt - 1);  
  perform(a,gt + 1,high);  
}

归并排序:

private final int cutoff = 8;  
  
  
@Override  
public <T> void perform(Comparable<T>[] a) {  
  Comparable<T>[] b = a.clone();  
  perform(b, a, 0, a.length - 1);  
}  
  
private <T> void perform(Comparable<T>[] src,Comparable<T>[] dest,int low,int high) {  
  if(low >= high)  
    return;  
  
  
  if(high - low <= cutoff) {  
    SortFactory.createInsertionSort().perform(dest,low,high);  
    return;  
  }  
  
  int mid = low + ((high - low) >>> 1);  
  perform(dest,src,low,mid);  
  perform(dest,src,mid + 1,high);  
  
  
  if(lessThanOrEqual(src[mid],src[mid+1])) {  
    System.arraycopy(src,low,dest,low,high - low + 1);  
  }  
  
  
  merge(src,dest,low,mid,high);  
}  
  
private <T> void merge(Comparable<T>[] src,Comparable<T>[] dest,int low,int mid,int high) {  
  
  for(int i = low,v = low,w = mid + 1; i <= high; i++) {  
    if(w > high || v <= mid && lessThanOrEqual(src[v],src[w])) {  
      dest[i] = src[v++];  
    }else {  
      dest[i] = src[w++];  
    }  
  }  
}

数据太多,递归太深 ->栈溢出?加大Xss?

数据太多,数组太长 -> OOM?加大Xmx?

耐心不足,没跑出来.而且要将这么大的文件读入内存,在堆中维护这么大个数据量,还有内排中不断的拷贝,对栈和堆都是很大的压力,不具备通用性。

sort命令来跑

sort -n bigdata -o bigdata.sorted

跑了多久呢? 24分钟.

为什么这么慢?

粗略的看下我们的资源:

内存

jvm-heap/stack,native-heap/stack,page-cache,block-buffer

数据量很大,函数调用很多,系统调用很多,内核/用户缓冲区拷贝很多,脏页回写很多,io-wait很高,io很繁忙,堆栈数据不断交换至swap,线程切换很多,每个环节的锁也很多.

总之,内存吃紧,问磁盘要空间,脏数据持久化过多导致cache频繁失效,引发大量回写,回写线程高,导致cpu大量时间用于上下文切换,一切,都很糟糕,所以24分钟不细看了,无法忍受.

位图法

private BitSet bits;  
  
public void perform(  
    String largeFileName,  
    int total,  
    String destLargeFileName,  
    Castor<Integer> castor,  
    int readerBufferSize,  
    int writerBufferSize,  
    boolean asc) throws IOException {  
  
  System.out.println("BitmapSort Started.");  
  long start = System.currentTimeMillis();  
  bits = new BitSet(total);  
  InputPart<Integer> largeIn = PartFactory.createCharBufferedInputPart(largeFileName, readerBufferSize);  
  OutputPart<Integer> largeOut = PartFactory.createCharBufferedOutputPart(destLargeFileName, writerBufferSize);  
  largeOut.delete();  
  
  Integer data;  
  int off = 0;  
  try {  
    while (true) {  
      data = largeIn.read();  
      if (data == null)  
        break;  
      int v = data;  
      set(v);  
      off++;  
    }  
    largeIn.close();  
    int size = bits.size();  
    System.out.println(String.format("lines : %d ,bits : %d", off, size));  
  
    if(asc) {  
      for (int i = 0; i < size; i++) {  
        if (get(i)) {  
          largeOut.write(i);  
        }  
      }  
    }else {  
      for (int i = size - 1; i >= 0; i--) {  
        if (get(i)) {  
          largeOut.write(i);  
        }  
      }  
    }  
  
    largeOut.close();  
    long stop = System.currentTimeMillis();  
    long elapsed = stop - start;  
    System.out.println(String.format("BitmapSort Completed.elapsed : %dms",elapsed));  
  }finally {  
    largeIn.close();  
    largeOut.close();  
  }  
}  
  
private void set(int i) {  
  bits.set(i);  
}  
  
private boolean get(int v) {  
  return bits.get(v);  
}

nice!跑了190秒,3分来钟.

以核心内存 4663M/32 大小的空间跑出这么个结果,而且大量时间在用于I/O,不错.问题是,如果这个时候突然内存条坏了1、2根,或者只有极少的内存空间怎么搞?

外部排序

该外部排序上场了.

外部排序干嘛的?

内存极少的情况下,利用分治策略,利用外存保存中间结果,再用多路归并来排序;

map-reduce的嫡系.

面试被问傻!5亿个数大文件怎么排序?

面试被问傻!5亿个数大文件怎么排序?

1.分

内存中维护一个极小的核心缓冲区 memBuffer ,将大文件 bigdata 按行读入,搜集到 memBuffer 满或者大文件读完时,对 memBuffer 中的数据调用内排进行排序,排序后将 有序结果 写入磁盘文件 bigdata.xxx.part.sorted .

循环利用 memBuffer 直到大文件处理完毕,得到n个有序的磁盘文件:

面试被问傻!5亿个数大文件怎么排序?

2.合

现在有了n个有序的小文件,怎么合并成1个有序的大文件?

把所有小文件读入内存,然后内排?

(⊙o⊙)…

no!

利用如下原理进行归并排序:

面试被问傻!5亿个数大文件怎么排序?

我们举个简单的例子:

文件1: 3 ,6,9

文件2: 2 ,4,8

文件3: 1

,5,7

第一回合:

文件1的最小值:3 , 排在文件1的第1行

文件2的最小值:2,排在文件2的第1行

文件3的最小值:1,排在文件3的第1行

那么,这3个文件中的最小值是:min(1,2,3) = 1

也就是说,最终大文件的当前最小值,是文件1、2、3的当前最小值的最小值,绕么?

上面拿出了最小值1,写入大文件.

第二回合:

文件1的最小值:3 , 排在文件1的第1行

文件2的最小值:2,排在文件2的第1行

文件3的最小值:5,排在文件3的第2行

那么,这3个文件中的最小值是:min(5,2,3) = 2

将2写入大文件.

也就是说,最小值属于哪个文件,那么就从哪个文件当中取下一行数据. (因为小文件内部有序,下一行数据代表了它当前的最小值)

最终的时间,跑了771秒,13分钟左右.

less bigdata.sorted.text  
...  
9999966  
9999967  
9999968  
9999969  
9999970  
9999971  
9999972  
9999973  
9999974  
9999975  
9999976  
9999977  
9999978  
...

来源: https://www.cnblogs.com/forea...

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原文  https://segmentfault.com/a/1190000022486001
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